Цитата: Доход по договору аренды получен в сентябре, октябре 2015 года ( после сбора урожая,т.к аренда производится в натуральном выражении), а налог НДФЛ удержан в январе 2016 г.
Если доход выплачен в натуральном виде, тогда другое дело.
Тогда да, это доход 2015 года и его надо было, действительно, отразить в 2-НДФЛ за 2015 год.
И, поскольку до конца года удержать налог не смогли, должны были сообщить об этом налоговикам.
С другой стороны, в январе удержали и уплатили в бюджет. Значит, к моменту, когда надо сообщить о невозможности, возможность появилась и налог удержали. Поэтому подавать 2-НДФЛ с признаком "2" уже необязательно.
Скорее всего, нужно было отразить эту выплату в 6-НДФЛ за 1 квартал.
В строке 070 - удержанный НДФЛ, и во втором разделе с датой в строке 100 за 2015 год и по строкам 110 и 120 - за январь 2016 года.
Это мое мнение. Подкрепить его письмом Минфина или ФНС не смогу.
Успехов!